那四个顾命大臣，名叫索尼、苏克萨哈、遏必隆、鳌拜，均是满洲的开国功臣。顺治皇帝逝世之时，遗诏命这四大臣辅政。其中鳌拜最为凶横，朝中党羽极众，清廷大权，几乎尽操于他一人之手。他生怕敌党对其不利，是以派出无数探子，在京城内外打探各种动静，这日得到密报，说到北京城中出现许多招贴，揭发浙江庄姓百姓著书谋叛，大逆不道，浙江官员受赂，置之不理等情。鳌拜得悉之下，立即查察，登时雷厉风行的办了起来。便在此时，吴之荣的禀帖也已递入鳌拜府中、他当即召见吴之荣，详问其事，再命手下汉人幕客细阅吴之荣所缴的那部原版明史，所言果是实情。

　　鳌拜初掌大权，意欲办几件大案，镇慑人心，不但使汉人不敢兴反叛之念，也令朝中敌党不敢有什么异动，当即派出钦差，赴浙江查究。这一来，庄家全家固然都逮入京中，连杭州将军松魁，浙江巡抚朱昌祚以下所有大小官员，也都革职查办。在明史上列名的文学之士，无一不是琅铛入狱。

　　顾炎武、黄宗羲二人在吕留良家中，将此案的来龙去脉，详细道来，吕留良听得只是叹息。次日一早，吕留良全家和顾黄二人登舟东行。江南中产以上人家，家中都自备有船，须知江南水乡，河道四通八达，密如蛛网，一般人出行都是坐船，至于船夫则有的长年雇在家中，有的临时雇用，所谓“北人乘马，南人乘舟”，自古已然。

　　到得杭州后，自运河折而向北，这晚在杭州城外听到消息，清廷已因此案而处决了不少官员百姓，庄廷已死，开棺戮尸；庄允城在狱中不堪虐待而死；庄家全数十口，十五岁以上的尽数处斩，妻女发配沈阳，给满州旗兵为奴。前礼部侍郎李令皙为该书作序，凌迟处死，四子处斩。

　　李令皙的幼子刚十六岁，法司见杀得人多，心肠软了，命他减供一岁，因按照清律，十五岁以下者得免死充军。但那少年道：“我爹爹哥哥都死了，我也不忍独生。”终于不肯易供，一并处斩。松魁、朱昌祚入狱候审，幕客程维藩凌迟弃市。归安、乌程的两名学官处斩。

　　因此案牵连，冤枉而死的人亦是不计其数。湖州府知府谭帝闵到任还只半月，朝廷说他知情不报，受赂隐匿，和推官李焕、训导王兆祯同处绞刑。吴之荣对南浔富人朱佑明心下怀恨最深，那日去打秋风，给他抢白了一场，逐出门来，当下向办理此案的法司声称，该书注明依据“朱氏原稿增删润饰而成”，这朱氏便是朱佑明了。这样一来，朱佑明和他五个儿子同处斩首，朱家的千万财产，清廷下令都赏给吴之荣。

　　最惨的是，所有雕版的刻工、印书的刷工、装钉的钉工，以及书贾、书铺的主人、卖书的店员、买书的卖者，查明后尽皆处斩。据史书记载，其时苏州浒墅关有一个榷货主事（关吏）李尚白，喜读史书，听说苏州阊门书坊中有一部新刊的明史，内容很好，派一个工役去买。工役到时，书店主人外出，那工役便在书铺隔壁一家姓朱的老者家中坐着等侯，等到店主回来，将书买回。

　　李尚白读了几卷，也不以为意。过了几个月，案子发作，一直查究到各处贩书买书之人，其时李尚白在北京公干，以购逆书之罪，在北京立即斩决，书店主人和奉命买书的工役捉到杭州斩首，连那隔壁姓朱的老者也受牵累，说他既知那工役来购逆书，何以不即举报，还让他在家中闲坐？本应斩首，姑念年逾七十，可以免死，和妻子一同充军到边远之处。（李尚白购买事，见萧一山所著《清代通史》）

　　至于江南名士，因庄廷慕其大名，在书中列名参校者，同日凌迟处死，计有茅元（其时在陕西朝邑县做知县）等十四人，其中吴之铭，吴之二人，还是吴之荣的兄弟。所谓凌迟处死，乃是一刀一刀，将其全身肢体肌肉慢慢切割下来，直至犯人受尽痛苦，方才处死。因这一部书而家破人亡的，当真是难以计数。

　　吕留良等三人得到消息，无不切齿痛骂。黄宗羲道：“伊璜先生列名参校，这一会也是难逃此劫了。”他三人和查伊璜向来交好，均是十分挂念。这一日舟至嘉兴，顾炎武在城中买到一份邸报，上面详列明史一案中获罪诸人的姓名，却见上谕中有一句说：“查继佐、范骧、陆圻三人，虽列名参校，然事先未见其书，免罪不究。”（事见邓之诚著《中华二千年史》）

　　顾炎武将邱报拿到舟中，和黄宗羲、吕留良三人同阅，无不啧啧称奇。黄宗羲道：“此事必是大力将军所为。”吕留良道：“大力将军是谁？倒要请教。”黄宗羲道：“两年之前，兄弟到伊璜先生家中作客，见他府第焕然一新，庭园宽大，陈设豪富，与先前大不相同。兄弟和伊璜先生向来交好，也不讳忌，便问起情由。伊璜先生说出一段话来，确是风尘中的奇遇。”当下便将这段故事转述了出来：

　　查继佐，字伊璜。（《觚剩》一书中有“雪遘”一文，述此奇事，开首说：“浙江海宁查孝廉，字伊璜，才华丰艳，而风情潇洒，常谓满眼悠悠，不堪愁对，海内奇杰，非从尘埃中物色，未可得也。”）这一天家居岁暮，命酒独酌，不久天下起雪来，越下越大。查继佐独饮无聊，走到门外观赏雪景，见有一个乞丐站在屋檐下避雪。这丐者身形魁梧，骨格雄奇，只穿一件破单衫，但在寒风之中，丝毫不以为意，查伊璜心下奇怪，便道：“这雪非一时能止，进来喝一杯如何？”那乞丐道：“甚好！”查伊璜便邀他进去，命书僮取出杯筷，亲自斟了杯酒，说道：“请！”那乞丐举杯便干，赞道：“好酒！”

　　查伊璜给他连斟三杯，那乞丐酒到杯干，饮得极是爽快。查伊璜最喜的是爽快人，心下喜欢，说道：“兄台酒量极好，不知能饮多少？”那乞丐道：“酒逢知己千杯少，话不投机半句多。”这两句虽是熟套语，但在一个乞丐口中说出来，却令查伊璜心下暗暗称异，当即命书僮捧出一大坛绍兴女儿红来，笑道：“在下酒量有限，适才又已饮过，不能陪兄畅钦。老兄喝一大碗，我陪小杯如何？”那乞丐道：“这也使得。”当下书僮将酒烫热，分斟在碗中怀内。

　　查伊璜喝一杯，那乞丐便喝一大碗。待那乞丐喝到三十余碗时，脸上仍无半分酒意，查伊璜却已颓然醉倒。要知那绍兴女儿红酒，入口温和，酒性却是厉害。绍兴寻常人家生下儿子女儿，却酿酒数坛至数十坛不等，埋入地下，待女儿长大嫁人，将酒取出宴客，那酒其时作琥珀色，所以称为“女儿红”。想那酒埋藏十七八年以至二十余年，自然醇厚之极。至于生儿子人家所藏之酒，称为“状元红”，盼望儿子日后中状元时取出宴客。状元非人人可中，多半是在儿子娶媳妇时用以飨客了。酒坊中酿酒用以贩卖的，也袭用了状元红，女儿红之名。

　　书僮将查伊璜扶入内堂安睡，那乞丐自行又到屋檐之下。次晨查伊璜醒转，忙去瞧那乞丐时，只见他负手而立，正在欣赏雪景。一阵北风吹来，查伊璜只觉寒入骨髓，那乞丐却是泰然自若。查伊璜道：“天寒地冻，兄台衣衫未免过于单薄。”当即解下身上的一件羊皮袍子，披在他的身上，又取了十两银子，双手棒上，说道：“些些买酒之资，兄台勿却。何时有兴，请再来喝酒。昨晚兄弟醉倒，未能扫榻留宾，简慢勿怪。”那乞丐接通银子，说道：“好说。”也不道谢，扬长而去。

　　第二年春天，查伊璜到杭州游玩。一日在一座破庙之中，见到有口极大的古钟，少说也有千斤之重，查伊璜正在鉴赏钟上所刻的文字花纹，忽有一名乞丐大踏步走进佛殿，左手抓住钟钮，向上一提，一口大钟竟然离地数尺。那乞丐在钟下取出一大碗肉，一大钵酒来，放在一旁，这才将古钟置于原处。

　　查伊璜见那乞丐如此大力，不禁骇然，凝神一看，竟然便是去冬一起喝酒的那名乞丐，笑道：“兄台还认得我吗？”那乞丐向他望了一眼，笑道：“啊，原来是你。今日我来作东，大家再喝个痛快，来来来，喝酒。”说着将土钵递了过去。