三月二十一日（己丑），李侍尧奏言：接副将丁朝雄等具报，郝壮猷收复凤山之信；窃意南路自此廓清，可用全力向北路会剿巢穴。及接黄仕简抄录折稿，称尚需驻兵搜捕，未敢遽离府城。是黄仕简既坐守郡城，而郝壮猷亦不能撤兵往北路会剿，可知。至北路之兵，虽据黄仕简奏，任承恩、普吉保、柴大纪及徐鼎士所带共有七千余名，查柴大纪收复诸罗后，以四旁尚多贼匪，仍驻诸罗，近又请兵协助；而徐鼎士在淡水北，又以艋舺等处民人恳求留驻，尚在禀商两提臣檄示：任承恩、普吉保在鹿仔港，虽据报屡有堵杀，而以贼尚鸱张，不敢轻进，又咨商黄仕简拨兵会攻。是该提、镇等各有牵掣，不免坐费时日，殊无可恃。惟望常青到彼，大加振作，方可制胜。常青临去时，其气甚壮，到台湾后，如遂能大胜一、二次，使贼党溃散，即可不必增兵。如实系贼多兵少，则与其旷日持久，收功缓而费转多，不如量为增调，以期迅速蒇事。但闽兵除先后派调外，各营存留较少；且兵律久弛，增调亦不得用。即如台湾额设戍兵，本有一万余名，当林爽文猝起时，仅柴大纪带一千数百名在盐埕桥堵守；而保护府城尚系兵民兼用。臣于二月十九日即咨询黄仕简、柴大纪等，令其查明缺额，以便拨补。又屡次札催，至今尚未覆到。是旧有之戍兵，已属有名无实，现在所用，祗内地调往之一万一千余名；而两月以来，情形又如此。将怯卒情，已可概见；是闽兵竟不必更调。臣前在两广时，知潮州、碣石二镇兵，尚属可用；且地近泉、厦，调遣亦便。臣于接印后，恐将来有需接济之处，曾密札孙士毅预备兵数千，以待缓急。昨接孙士毅札，已密选四千；并称南澳镇陆廷柱情愿带领前往，可即派为总统大员；其余将弁亦已预行选派等语。臣现飞札常青察看，如果必须增兵，一面具奏，一面即飞咨孙士毅调遣起程，可不至稽缓。再，常青于二月三十日申刻已经放洋；嗣因风■〈日凡〉不顺，屡出屡回。据厦防同知刘嘉会本月初五日具报，尚在料罗暂泊。臣心不胜焦急，惟有敬诣天后宫行礼，祈求顺风，俾得速渡。再，厦门同知刘嘉会解到铜山营逃兵汪中鲤、王正荣二名。缘上年十二月初七日，随同守备董得魁在中港抵御，被贼冲散，私自 逃回。赴水师参将衙门捏报董得魁差令往台湾镇求救，因陆路被贼阻隔，由大鸡笼搭船遭风飘至铜山。随经饬查实系逃回，即将该二犯正法。至许阿协所供邀入会者，系赖阿边、赖阿立二人；赖阿恩林阿俊所供邀入会者，系梁阿步一人。而赖阿恩之子赖娘如、林阿俊之子林阿真，俱在梁阿步戏班内唱戏。孙士毅行知闽省缉获。臣到泉州，该府、县已将各该犯拿获，先后解到。臣以此案人犯，未经查拿，自当缓办，既经获解，又不便迟留，随委司道、府等严讯。据各犯坚供，不过素相认识，并无纠约入会情事。臣以事关重案，该犯等或因许阿协等俱在粤省，无凭质对，是以串供狡赖。委员将赖阿边、赖阿立、梁阿步、赖娘如、林阿真五犯解赴粤省。孙士毅现驻潮州，自可就近审理；一经质讯，即当水落石出，以成信谳。本日，又准孙士毅咨称，续拿林功裕一犯，又供出赖阿德、洪李桃、张阿和、李九陶、林三长、朱洪德、张攀桂七名，俱系闽省天地会内人犯。是闽省为此教之渊薮无疑。惟是漳、泉一带，民情轻慓，去冬已多讹言，近日渐觉宁贴，则正可以相安于无事；若四处查拿，恐又添一番惶惑，或别滋事端。臣谨将孙士毅所咨人犯，面谕地方官密为存记，统俟台湾剿匪事竣后办理；并知会孙士毅将粤省获犯暂行监禁缓办。奏入。李九陶、林三长、朱洪德、张攀桂七名，俱系闽省天地会内人犯。是闽省为此教之渊薮无疑。惟是漳、泉一带，民情轻慓，去冬已多讹言，近日渐觉宁贴，则正可以相安于无事；若四处查拿，恐又添一番惶惑，或别滋事端。臣谨将孙士毅所咨人犯，面谕地方官密为存记，统俟台湾剿匪事竣后办理；并知会孙士毅将粤省获犯暂行监禁缓办。奏入。李九陶、林三长、朱洪德、张攀桂七名，俱系闽省天地会内人犯。是闽省为此教之渊薮无疑。惟是漳、泉一带，民情轻慓，去冬已多讹言，近日渐觉宁贴，则正可以相安于无事；若四处查拿，恐又添一番惶惑，或别滋事端。臣谨将孙士毅所咨人犯，面谕地方官密为存记，统俟台湾剿匪事竣后办理；并知会孙士毅将粤省获犯暂行监禁缓办。奏入。
上命军机大臣传谕常青、李侍尧、孙士毅曰：李侍尧亦看出黄仕简、任承恩二人贻误情形，但所奏未免略迟。现在，惟望常青到彼大加振作，方可制胜。如该督到彼，即将贼匪一鼓歼擒，自属甚善；如贼匪负嵎抗守，剿捕稍需时日，自应量为增调兵丁，以期迅速蒇亭。但闽省之兵存营者已少，且该省兵力久弛，现在派往台湾者，零星打仗，又复气馁，更恐不能得力，不如就近于粤省挑选预备。李侍尧筹虑及此，已咨孙士毅密为调备，尚为周到。惟粤省所备之兵，既有四千名，恐陆廷柱一人不能照料；高廉镇梁朝桂曾在军营打仗，于军务自为熟悉，着孙士毅即密扎该镇，速赴闽、粤交界处所驻扎，听候调遣。至台湾额设兵共有一万余名，林爽文滋事时，作何调拨堵御？何以柴大纪在盐埕桥拒守，亦止带兵一千数百名？此外兵丁又在何处？柴大纪此次保护郡城，虽为出力，近日以来，渐觉观望不前；常青到台湾后，一并查明据实具奏。又据李侍尧奏，漳、泉一带，民情轻慓，近日渐觉宁贴；所有粤省咨拿天地会各犯，现密为存记，俟事竣后办理等语；所办甚是。着孙士毅即照李侍尧所奏，将现获各犯暂行监禁，俟事竣后，再为办理。
上又谕内阁曰：台湾逆匪林爽文等纠众滋事，水陆两提督带兵分路进剿，并不亲临行阵，定期会攻，致贼匪日久未就扑灭。节经降旨严饬，并谕令常青据实严审查参。兹据李侍尧奏到军务情形折内称，南北两路，该提、镇等各有牵掣，不免坐费时日等语。果不出朕所料。黄仕简承恩最久，向来办事尚属黾勉，乃于剿捕逆匪一事，漫无筹画，因循玩误。本即应拿问治罪，姑念其年老，且系病后，着常青将黄仕简即遵前旨送回厦门内地候旨。水师提督着郝壮猷暂署。至任承恩，经朕屡加拔擢用至提督，且系自请前赴台湾剿贼，伊年力正强，理应加倍奋勉，乃亦逡巡畏葸，与黄仕简互相诿卸，实属辜负朕恩。即着传旨革职拿问，交刑部治罪。其陆路提督员缺，前因柴大纪保守郡城，尚为出力，本欲将伊擢用；但柴大纪于林爽文等滋事之先，不能预为防范；且台湾原设兵额一万余名，该镇督率守城之兵，不过一千余名，此外兵丁现作何用，并未据柴大纪奏及，实有应得之咎。所有福建陆路提督员缺，即着蓝元枚调补。
二十二日（庚寅），上命军臣机大臣传谕常青、李侍尧曰：昨经降旨将任承恩革职拿问，黄仕简撤回厦门。其水师提督员缺，即令蓝元枚调补；所有陆路提督员缺，除柴大纪另看其如何奋勉、将功抵罪？其余总兵郝壮猷、普吉保二人，现在台湾带兵打仗，尚属黾勉；常泰虽未带兵前往剿贼，然在漳州一带，弹压地方，亦为镇静有方；该镇系股简调之人，着传谕常青、李侍尧于郝壮猷、普吉保、常泰三人内，察看孰为出力并才具堪胜提督者，保举一人。一面将陆路提督印务令其署理；一面会同据实具奏，候朕简放。
二十三日（辛卯），李侍尧奏言：柴大纪在诸罗咨请两提臣拨兵协助，任承恩在鹿仔港又檄徐鼎士带兵会攻，徐鼎士复以艋舺民人恳求留驻尚在未行各情形；是任承恩、柴、大纪等，非惟不能合剿大里杙，并诸罗、彰化间道路亦未疏通。又罗礼璋巡查至扈尾庄，被贼数千围住，徐鼎士闻知，遣兵并力抵御，贼始退去。是徐鼎士亦未能即往任承恩处会合。看来，各提、镇等彼此相待，坐废时日，固不待言；而处处被贼牵掣，官兵不敷调用，加以相持日久，贼党益多，兵气渐馁，亦属实情。而黄仕简于二月二十七日续调澎湖兵二百赴台湾，则南路又似有需添兵之处。常青至府城，即欲向北路会剿，看来已无兵可带，亦必不能不请增兵。该处远隔重洋，风■〈麻上骨下〉不常，动需时日；若俟常青咨会到臣，始行调集，往返又辄月余。臣既确见实在情形，不敢稍有迟缓，致误事机。昨据孙士毅札称，已选兵四千，并将弁等亦密行拣派，而总兵陆廷柱曾任台湾，情愿带兵前往。臣一面知会常青，一面飞咨孙士毅迅将预派之将弁兵丁，克日起程，一由厦门赴鹿耳门，一由蚶江赴鹿仔港。由厦门者，令陆廷柱带往；查南路郝壮猷尚在凤山，常青无大员同行，陆廷柱到时，正可资臂指之助；由蚶江者，令将备带往，听任承恩、普吉保等驱策；似于两路俱有裨益，而兵事可以迅速奏功。再常青、杨廷桦俱于初六日戌刻，在料罗放洋。又南澳镇系闽、粤两省兼辖，向例委署总兵，闽、粤两省督臣轮流派委。此次，陆廷柱带兵前往台湾，所有总兵员缺，轮届闽省委署；闽省将领出征者多，无员可委，臣一并咨明孙士毅听其酌量委员署理。奏入。
上命军机大臣传谕常青、李侍尧、孙士毅曰：台湾初起事时，朕即不愿任承恩前往者，恐二人不相统属，未免有推诿观望之事。因将李侍尧调补闽浙总督，并令常青前往台湾督办，以防缓不济急。幸而事事预为布置，否则，该处止有常青一人，既不能分身前往，而黄仕简、任承恩今竟如此因循贻误，贼匪日久蔓延，设乘间别生枝节，致蹈从前朱一贵滋扰故辙，或竟如木果木之失事，尚复成何事体耶！今李侍尧果看出该提镇彼此观望，坐废时日，贼党益多，兵气渐馁，不俟常青知会，即飞咨粤省令预派之将弁兵丁克日起程。筹办甚为周到，动合机宜，颇慰朕怀。惟粤省预备之兵，既有四千名，恐陆廷柱一人不能照料，昨已有旨令梁朝桂赴闽、粤交界处所，听候调遣。着孙士毅即飞扎梁朝桂速行前往，带兵赴鹿仔港，勉力会剿。从前贼匪初起时，孙士毅调发弁兵前往策应，朕以本省兵力已厚，是以降旨谕令撤回。今复需征调，虽似多一番往返之劳，然竟实受撤回之益。设使彼时粤兵早抵台湾，不过分属任承恩、黄仕简二人带领，仍派令零星打仗。该兵丁见闽兵不能得利，自必日渐气馁，徒使有用之兵，亦归无用。此番新调之兵，初抵台湾，听常青带领，其锐气方盛，正可资其生力，转于军务有裨。至黄仕简、任承恩玩误紧要军务之罪，均应按律正法。但念黄仕简年老又系病后，且伊从前办事尚属黾勉，姑贷其一死，令其退废家居，自思咎戾；所有公爵仍加恩令伊长孙承袭。至任承恩之父任举，前在金川阵亡，任承恩又现无子息，朕轸念前劳，不忍令捐躯殉忠者绝嗣，任承恩俟刑部照例定拟具奏时，尚可加恩贷其一死。但老师糜饷之罪，伊二人百身难赎。若使幸免余生之人坐享丰厚，不足以示废弛军旅之戒。将来事竣后，所有多延时日糜费之军需银两，均应于黄仕简、任承恩名下追赔，以示惩儆。至常青于初六日放洋，现在早抵台湾，务照节次所降谕旨，悉心筹画，妥速督办。
二十四日（壬辰），上命军机大臣传谕常青、李侍尧曰：徐鼎士于上年十二月，即经常青、徐嗣曾派令带兵一千五百名，赴台湾进剿；乃该副将所带之兵，屡称因风阻滞，直至二月初旬始据禀报陆续前赴淡水，已不免迟延。及到鹿仔港，总未报其剿杀一贼。现经任承恩檄令带兵会攻，复以艋舺民人恳求留驻，并未前往会剿。看来，竟系有心逗留，畏葸不前，借词支饰，不可不严行查办。行军之道，全贵纪律严明，信赏必罚。若将弁临阵出征，心怀怯懦，惟恐遇贼接仗；而畏葸退避者，即可幸免无事，使人人效尤，则将弁兵丁，又孰肯奋勇直前致命效死耶！着常青即严查该副将，前赴台湾曾否稽迟，及现在任承恩檄调，何以不行前往？若徐鼎士果有畏缩逗留，托词规避之处，即应立行拿问，据实参奏；当按军法从重办理，俾在事兵弁咸知儆畏。并着李侍尧一体严切访查，据实参奏。至柴大纪自派往诸罗以后，于剿捕一切不能如从前之出力，并着常青一并查奏。
二十六日（甲午），上命军机大臣传谕常青、李侍尧曰：黄仕简、任承恩于本月十二、十四等日奏到之后，迄今将届半月，何以并未将剿捕情形，随时奏报？况朕因黄仕简畏缩不前，是以特派常青前往督办。尹二人一闻此信，苟稍有人心，即当自知愧惧，趁常青未到之前，亲带弁兵迅速进剿，以冀将功抵罪。乃竟阅多日，并未将如何剿捕情形，具折驰奏。可见伊二人竟系自甘颓情，观望玩延，其贻误之罪，更无可逭。着该督即将黄仕简、任承恩于前次拜发奏折后，此十余日内，在彼办理何事，何以并无一字奏及之处，据实查明参奏。
二十七日（乙未），李侍尧奏言：接到海防同知杨廷理禀称，较臣所访更为详悉。所云现在兵数，合之则多，分之则少，尤觉切中窽要。并称台郡与凤山连界之水底藔等处，尚有庄大田等贼出没焚掠，则南路之兵，似不能尽撤，致府城有单薄之虞。查台湾合各路现有之兵，仅一万三千有余。看来，常青欲往北路会剿，祗能于府城及南路兵内抽调一千余名；到诸罗后，再增柴大纪之兵千余名，力量尚觉未厚。臣奏调粤兵内，檄令以二千五百名由鹿耳门进口，常青得此，庶觉军势壮盛。至任承恩处，旬日以来，久不得信。兹据该同知另禀，有鹿仔港船户来郡，询知二月十三贼匪来攻大营，任承恩、普吉保等大加剿杀，贼匪死伤无算等语。又有解饷之经历邹贻诗禀亦相同。但未见任承恩等奏报过境，想因风水不顺，阻搁在途。臣谨抄录原禀及所绘图，一并进呈。奏入。
上命军机大臣传谕常青、李尧侍曰：本日李侍尧奏到台湾情形一折，并抄录海防同知杨廷理原禀。据称贼匪滋事以来，大兵仅属固守，皆以兵单难于远捕为辞。如彰化早经恢复，而任承恩驻兵鹿仔港，普吉保驻兵埔心庄；诸罗收复月余，而柴大纪驻兵城外；凤山甫经收复，郝壮猷分驻四门静守；黄仕简驻守郡城，以致贼匪各路啸聚。现在台湾之兵，统计一万三千有余，合之则多，分之则寡等语。该同知所禀各情形，早在朕遥度之中。可见兵力以分而见单，伊等贻误，实由于此。昨经降旨将任承恩革职拿问；尚以黄仕简年老有病，仅令革职撤回内地。今伊等如此玩误，则二人厥罪维均，黄仕简亦难稍为宽宥。着李侍尧一俟黄仕简回厦门，即传旨一并革职，拿交刑部治罪。至该提督等株守玩延，致令将弁等效尤观望，不能早擒贼首，俾贼匪得转相啸聚，逼胁平民。其中不肖之徒，势必与贼乌合，日积日众，滋扰蔓延。昨经李侍尧奏添调粤兵四千名，一由厦门赴鹿耳门；一由蚶江赴鹿仔港等语。看此情形，常青处所有之兵，尚未免单薄，着传谕李侍尧如粤兵尚未分路配渡，即檄令全赴鹿耳门，直抵台湾府城，俾常青处兵力壮盛，足资调遣。如业经分路配渡前进，着常青于粤兵将抵鹿仔港者，亦即调来合为一处。常青亲带勇往将弁，径赴大里杙贼巢，鼓励弁兵务将首恶林爽文一鼓擒获，其余贼众，不难扑灭净尽。又阅该同知原禀内，现在府城、诸罗、彰化之间，各处皆有贼人屯集。常青经过地方，中途遇有贼匪抗拒，正可痛加歼戮，俾贼匪闻风胆落，路途无阻，直指贼巢。此事，惟仗常青遵照节次指示，悉心筹办，纾朕南顾，不致复蹈黄仕简、任承恩故辙也。其柴大纪、郝壮猷、普吉保因二提臣观望，不无效尤，今二提臣已拿问，其柴大纪三人效尤之罪，且赦不问，令其效力带兵赎罪。如伊等亦有畏葸观望情事，或不可令其效力，即着常青据实参奏，毋得稍有徇隐。
同日，孙士毅奏言：赴惠、潮一带海口，督拿窜犯、搜捕会匪途次，接准闽浙督臣李侍尧密札，台湾贼匪尚多，南北两路未能会剿，常青到彼或须酌量增兵，以期一举蒇事。向知潮州、碣石二镇兵尚可用，嘱臣慎密预备。查来咨虽称此次兵丁果否征调，尚在未定；但既有酌量增兵之语，自应迅速预备，以便克期就道。臣一面密饬潮州、碣石水陆二标及附近各营，共挑足四千之数，迅即派定分起来潮。兹臣于三月初七日抵潮，提臣高■〈王〈艹佘〉〉亦巡查到此，一切预备事宜，现在会商妥办。再闽省尚须集兵搜捕，似内地查拿会匪一事，尚宜慎密。臣与闽省现已彼此关会存记，俟一举荡平，再行从严办理。又南澳镇总兵陆廷柱统领官兵赴台，遗缺请以澄海协副将郑元好护理。其澄海协员缺，请以广海寨游击张天宿护理。又，香山协谢廷选、罗定协贵林、肇庆协官福，现亦领兵，请以左翼镇游击黄锡侯护理香山协印务，督标前营参将新泰署理罗定协印务，督标水师营参将刘天爵兼署肇庆协印务。至查察惠、潮一带沿海口岸汛地，尚属整肃。臣俱面谕该管文武，密为侦伺，果有踪迹可疑者，方许立时盘诘解究，不得一味惊扰，以致商民裹足。据饶平县续获会匪陈阿塔、余阿绪二名，余阿绪供系徐阿番勾引入会，其所传暗号、歌诀，均与前获之许阿协等大略相同。其供出伙党，俱密为存记。至前此许阿协等供出闽省勾引入会之梁阿步、赖阿边等，经李侍尧因该犯等坚不承认，解粤质审。臣俟该犯等解到，彼此画一密办。奏入，报闻。
二十八日（丙申），孙士毅奏言：此次密派官兵，俱已酌定起数，预为妥备。今定于三月十六日，即令头起官兵自潮起程。每起二百五十名，间一日行走。自粤省黄冈入闽省诏安境，相去止数十里。自诏安至厦门、蚶江等处，亦止数日可到。照依李侍尧派定数目，以二千五百名赴厦门，一千五百名赴蚶江，配船渡海。臣与提臣高■〈王〈艹佘〉〉往来弹压稽察，沿途派令惠潮道图毕赫、潮州府孙泳、惠州府顾声雷督率，经过之各州县妥协照料，催趱前进；并多备火药及裹带一月口粮，俾资接济。其弁兵应得分例，量为借给，俟将来闽省定有章程，再行画一办理。奏入。
上命军机大臣传谕常青、李侍尧、孙士毅曰：据孙士毅奏，是该省官兵全数在潮起程，已在四月中旬加以配渡放洋。计四千名陆续全抵台湾，极早亦须至四月下浣。常青于三月初六日起碇放洋，不过初十内外，业抵台湾。若必俟粤兵到日，始行进剿，则蒇事之期，竟需至五月，岂不旷日持久。着传谕常青体察情形，若台湾现有之兵，一经鼓励，觉属可恃，即择其精壮者，亲身带至大里杙贼巢，痛加歼戮，将首逆林爽文擒获；其余附从，自纷纷瓦解，固属甚善；如该处之兵，实不可恃，必须接济，或俟粤省数起官兵到后，酌量足敷剿捕，即带同前往，俾新旧间用；庶新到者勇气方张，旧存者心有可恃，亦自必旌旆改观。不可拘泥必待粤兵到齐，始行办理，致再迟延。或台湾现有之兵，其气已馁，必须全仗粤兵到齐，方能前往剿捕之处，常青亦不可因有此旨，稍存轻率之见，务在相机妥办，动出万全，以副委任。至粤省未经起程官兵，着孙士毅即另行筹酌，令其并起行走，并先知会李侍尧预备渡船。其已入闽境官兵，着李侍尧飞饬沿途催趱前进。李侍尧即当亲至厦门料理，随到随渡。至此事，总由黄仕简、任承恩二人互相观望，以致久稽蒇事，其罪实无可逭。孙士毅驻扎潮州，相距不远，其于黄仕简、任承恩玩误之处，自必有风闻。着该督即将所闻据实覆奏，勿稍回护。