崔胤字垂休，是宰相慎由的儿子。
考中进士，升官至中书舍人、御史中丞。
喜弄阴谋，附依权势。外表看起来简朴谨慎，实则内心险诈狡猾。崔昭纬多次荐举他，由户部侍郎同中书门下平章事。
其时王珙兄弟争河中之职，派胤为节度使，不能赴任。半年后，仍以中书侍郎职留京辅政。及至崔昭纬犯罪被杀，胤被贬为武安节度使，陆..执政。其时王室孱弱，南、北司各树党羽结交藩镇，内部相互排挤。胤一向与朱全忠要好，倾心与之联结。全忠上言胤有功劳，不宜安置在京都外，故而召回仍为宰相而驱逐陆..。
光化初年，昭宗自华州返都，力求抚平内部，而崔胤暗中为朱全忠撑腰，使他拥兵四出讨伐。皇帝厌恶他的做法，贬他为吏部尚书，又倚重陆..为宰相。适逢清海缺统帅，于是任胤为清海节度使。
当初，崔昭纬之死，都是王抟等人揭发其罪状的，胤连累遭贬，心中记恨。待到与王抟同为宰相，胤建议罢黜所有宦官，王抟不支持并劝说皇帝慢慢来。如今皇帝又把他外调了，就把王抟对皇帝说的话告诉全忠，要他揭发弹劾王抟依附宦官共谋害国，其罪该杀。其时崔胤在湖南，皇帝召回，仍居司空、门下侍郎、平章事，兼领度支、盐铁、户部使，而赐王抟自尽。
中尉宋道弼、景务..等人也都被诛。从此崔胤权震天下，虽宦官亦皆侧目屏息。
到此，胤四次拜相，人称“崔四入”。
中尉刘季述将皇帝幽禁在东内，拥戴德王执政。刘季述虽深恨胤，但惧怕全忠的强悍，不敢杀胤，只是罢免了他的政府职务。胤催促全忠发兵西进，责问季述幽禁皇帝的罪状。全忠派张存敬攻河中，掠取晋、绛。神策军大将孙德昭常表现出对阉人软禁侮辱天子的事十分愤懑，胤指使判官石戬与德昭交游，窥察其心。德昭每次醉酒后必哭，胤探得他的心事后，就要戬去劝说：“自从刘季述废天子，天下人从未忘记，武夫义臣都切齿痛恨。此次谋反，只是季述、仲先罢了，别人慑于他们的权威，并未参与谋划。
如果你能诛杀这两个混蛋，迎皇上复辟，岂不功成名立？如果不早打算，这功怕会被别人抢先了呢。”德昭认为对，戬于是把胤的计谋告诉他，德昭同意，胤割断衣带与他盟誓。不久就杀了季述与仲先。论功升胤为司徒，胤辞谢不就，仍使辅政，归还被夺的政职。皇帝感胤之恩，每次接见他不称其名而呼其字，胤所得宠遇无可比拟。
天复元年(901)，全忠已攻陷河中，进逼同州、华州。中尉韩全诲因胤与全忠要好，担心会诱导全忠来清君侧。于是要求皇帝罢胤的政职，没等到皇帝同意下令，就急匆匆地把皇帝挟持到凤翔。
胤恨皇帝被挟持，不肯跟去，召全忠领兵来迎回天子，令太子太师卢渥率群臣欢迎全忠。起先，全忠到华州，派幕府裴铸奏事，皇帝不得已，只好听任他来朝。至此，胤为他策划，用兵威慑行营。皇帝下诏促他回镇。同时诏令卢渥等人西来。
全忠上表说：“过去写诏书都由宰相执笔，如今得知不是陛下的本意，臣已被他误引。现军队已经入关，请求能与李茂贞相约消除误会，共同迎接銮驾回京。”
茂贞却弹劾道：“崔胤畜养玩命之徒，竟然支用专利之款，又令亲信陈班与京兆府募兵保卫其私宅。天子出巡，派五位使者去召他，他安卧不动，只是上表辞谢。”当时皇帝见了全忠的表也很生气，于是下诏书严责崔胤，命他为工部尚书，免除其政职，胤出京居于华州。
当初改元天复后，宦官们对崔胤委屈听命，无事不先和他商议。每次皇帝与他在宫中议论军政大事，往往谈到天黑。胤建议除绝所有宦官，令宫人掌管宫内事宜。韩全诲等探知后，一起到皇帝面前乞求哀怜。皇帝于是诏令胤以后有所奏请时，都用书面密封，免被窃听。
宦官们越发恐惧，更加想知道胤的计谋。
于是找到识字的美女宗柔等人，安排在皇帝左右，侦察他们的计划。胤的计谋渐渐泄露出去，宦官们或哭泣或怨恨，人人自危。劫持天子的计策就这样确定了。
崔胤在华州时，多次替全忠筹划歹计。全忠率兵回驻河中，胤到渭桥迎接，向全忠敬酒，还亲自唱歌以助兴。其时李茂贞杀死韩全诲等人，与全忠言和。
皇帝急召崔胤，墨笔诏书发了四道，朱笔御札也发了三封，但胤却称有病而辞谢。
及至皇帝离开凤翔到全忠军中，胤才在路上迎接圣驾。仍任他为平章事，晋升司徒，兼掌六军十二卫等事。又下令将他的家迁居右军，赐给帷帐器用等物十车。胤奏道：“高祖、太宗时没有内侍掌军权的。天宝以后宦官权渐盛。德宗分羽林军为左右神策军，令宦者主掌，不过以二千人为限。以后参与执掌机密，以致内务百司全归中人主管。他们彼此包庇为非作歹，朝廷权威减弱。祸患就是从这里开始的。恳请罢斥左右神策、宫内各司使以及各道监军。”于是宫内外宦官全部诛杀，诏命的传送宣读只用宫人宠颜等人。
皇帝在凤翔时，用卢光启、苏检为宰相，胤都把他们赶走杀掉。对跟随去凤翔的近臣陆..等三十多人也都罢斥，只有裴贽一向孤立可控制，留下共掌政事。
至此，皇帝的动静全取决于胤，没人敢说一句话。胤建议由皇子为元帅，全忠为副帅，以示褒奖他迎驾的功劳。全忠私心觉得辉王年幼可利用，所以胤有这样的建议。皇帝说：“濮王年长，派他如何？”回到宫中召翰林学士韩亻屋商量，亻屋暗中助胤，终于不能改变胤的建议。全忠东归，群臣列班直送至长乐驿，胤更远送到灞桥饯行，欢饮至二更天才回。皇帝立时召见问“：全忠一路顺利吗？”又与胤对饮，命宫女做舞剑曲，直至四更天。
胤回去，还赐两个宫女，胤坚持辞谢才作罢。这时，天子孤危无助，威严全失，胤的挟持皇帝竟到了这地步。又进官侍中，封爵魏国公。
自凤翔回京，崔胤揣度全忠有篡夺之心，自己位居宰相，担心哪一天祸发，因此想掌握一部分兵权。他假意对全忠说“：京师太靠近李茂贞，不可不防，需要募兵守卫。如今左右龙武军、羽林军、神策军徒有虚名。请每军设置四名步将，每将率领二百五十人；设置一名骑将，率领一百人。让他们轮番值卫。”派京兆尹郑元规为六军诸卫副使，陈班为威远军使，在京师市井募兵。全忠明白他的意思，表面同意。胤于是拆毁佛塔，取铜铁做兵械。全忠暗中让手下的汴人几百个来应募，又派儿子朱友伦入宿卫军。一次玩球，友伦不幸从马上跌下身死，全忠怀疑是胤的阴谋，大怒。当时，有传言说崔胤将挟持皇帝到荆、襄，而全忠也正打算胁迫皇帝在洛阳建都，担心其建议会遭到反对，于是密表揭发崔胤专权乱国的罪行，请问罪诛杀。皇帝遂罢胤为太子少傅。全忠令儿子友谅带兵包围开化坊崔宅，杀死崔胤。应募的汴州兵士都出来控制局势，市民们争相用瓦砾掷击胤尸，该年胤五十一岁。郑元规、陈班等都被杀。此乃天复四年(904)正月之事。
崔胤罢官后三天被杀。死后十天，全忠胁迫皇帝迁居洛阳，并将长安的居民都赶出东迁，拆房子的木材在渭河中顺流而东。老人孩子也赶上路，啼哭声沿路不绝，都大骂：“国贼崔胤引来朱全忠出卖社稷，使我们流离失所。”起先，全忠虽据有河南，但各强悍诸侯互相牵制，还不敢决然篡夺。及至崔胤离间宫廷，与他相结，才得步步实现野心，取皇权而成强大之势，终于亡唐天下。崔胤身被杀，宗族遭灭。世人说崔慎由晚年无子，曾遇见一个怪和尚，得到他的法术，才生了胤，取字缁郎。及胤任宰相，他叔父崔安潜曾感叹“：我们父兄辈刻苦以保持的门户，将来一定会被缁郎败坏的。”