萧孝穆，乳名胡独堇，淳钦皇后弟阿古只五世孙。父萧陶瑰，官居国舅详稳。
孝穆洁身谨慎，谨守礼仪法度。统和二十八年(1010)，累迁至西北路招讨都监。开泰元年(1012)，遥授建雄军节度使，加检校太保。同年，术烈等猝然生变，孝穆攻打并赶走他们。冬日，进军可敦城。阻卜纠集五群牧长查剌、阿睹等，阴谋内外互相策应，孝穆全部杀死他们，于是严整守备以待，余党于是溃散。因功迁九水诸部安抚使。不久拜北府宰相，赐为忠穆熙霸功臣，检校太师，同政事门下平章事。八年(1019)，回京师。
太平二年(1022)，主持枢密院事务，充任汉人行宫都部署。三年，封燕王、南京留守，为兵马都总管。九年(1029)，大延琳在东京叛乱，孝穆为都统讨伐之，接战于蒲水。中军向后略退，副部署萧匹敌、都监萧蒲奴从两翼夹击，贼兵溃散，追击败之于手山北。延琳逃入城中，掘深沟自卫。孝穆包围之，建起重城，修造楼橹，使城内外不得相通，城中撤房屋以烧火做饭。其将杨详世等擒延琳而降，辽东全部平定。改为东京留守，赐佐国功臣。为政致力于宽厚简约，招抚流民，百姓得到安宁。
兴宗即位，迁为秦王，不久又为南京留守。重熙六年(1037)，进封为吴国王，拜北院枢密使。八年(1039)，上表请登记天下户口以平均徭役，又陈说诸部及舍利军的好处和害处。从之。由此征收赋税稍稍平均了一些，众人大悦。九年(1040)，迁为楚王。当时天下无事，人口增殖，皇上又青春鼎盛，每每谈及后周夺取十县，总是感慨愤激，有南伐之志。群臣大多顺从旨意。孝穆劝谏说“：从前太祖南伐，最终无功。嗣圣皇帝太宗灭唐立晋，后因重贵叛盟，长驱入汴京，皇上刚刚回师，南方反过来突袭我。从此以后兵连祸结达二十余年，刚刚得到和好，百姓安居乐业，南北互通有无。现在国家比起往日，尽管变得富强了，然而功臣、老将往往已经过世。何况宋人无罪，陛下不应该背弃先帝所订立的盟约。”当时皇上心意已决，奏书上达没有回音。以年老请求辞官回乡，不许。十二年(1043)，又为北院枢密使，改为齐王，薨。追赠大丞相、晋国王，谥曰贞。
孝穆尽管身为外戚之亲，职位越高，越是畏惧小心。太后有赐物，则推辞不受。即使在妻子儿女面前也没有骄傲之神情。与人交往，始终如一。所荐举的都是忠直之士。曾经对人说“：枢密选拔贤能而进用之，何事不能成功？如果亲自去处理琐碎之事，那么大事反而被耽搁了。”自从萧合卓因为为政有才得到进用，其后递相效尤而已，不懂得有关大局的道理。孝穆感叹说：“不能够移风易俗，身居高位却苟且偷安，为臣之道竟然是这样的吗？”时人称孝穆为“国宝臣”，称所著文集为《宝老集》。二子阿剌、撒八，弟孝先、孝忠、孝友。